Se recuerda el calendario de entrada en vigor del Sistema EMCS:
1 de Enero de 2011: el sistema EMCS será obligatorio para todos los envíos que vayan a circular por los países de la UE.
1 de Enero de 2012. Arranque de la Tercera Fase del Proyecto EMCS, que incluye las siguientes novedades:
a. Modificaciones en los mensajes existentes. Algunos ejemplos son añadir información adicional en múltiples campos, o detallar los códigos de producto para cada partida del envío/recepción.
b. Mensajes nuevos:
- Emitir y recibir alertas antes de la recepción de la mercancía.
- El Expedidor / Receptor podrá explicar sobras o faltas de producto.
- El Expedidor / Receptor podrá recibir comunicaciones de incidencias en los movimientos de producto por parte de las administraciones.
- Un destinatario podrá rechazar un envío antes de recibir la mercancía.
Exisitirá un periodo de adaptación entre la Fase 2 y la Fase 3. Así pues, ambas fases coexistirán con validez legal durante 3 meses (hasta el 31 de marzo de 2012), de modo que los operadores podrán elegir libremente en qué fase trabajar. A partir del 1 de abril de 2012 la AEAT obligará a trabajar en Fase 3. En este periodo transitorio el usuario del sistema EMCS deberá solicitar a la AEAT su baja en la fase 2 y su alta en la fase 3.
1 de Enero de 2013: el sistema EMCS entrará en vigor para todo tipo de envíos, ya sean Nacionales, UE, o Exportación.

